删除站点后，过段时间会自动生成站点名字的目录

使用了Let's Encrypt免费ssl证书吗？
请执行 ~/.acme.sh/acme.sh --remove -d www.example.com 其中www.example.com为你要删除的Let's Encrypt对应域名

[Sun Apr  7 02:29:15 CST 2019] -d is not a issued domain, skip. 

是用的 Let’s Encrypt 但是没有成功。

update: 你给出的命令不能用

remove

要改为

--remove

即

~/.acme.sh/acme.sh --remove -d www.example.com

删除证书文件：

rm -rf ~/.acme.sh/acme.sh/www.example.com